次世代定序 (Next Generation Sequencing, NGS)

次世代定序 (Next Generation Sequencing, NGS)

次世代定序 (Next Generation Sequencing, NGS) 自2000年後被廣泛應用於各領域,包含: 基因體學 (Genomics)、轉錄體學 (Transcriptomics)等。除學術研究領域外,在臨床檢測 (Clinical test)、癌症篩檢 (cancer screening) 與藥物研發 (Drug development )也扮演重要的角色。

西元 2005 年Roche 推出 Roche 454 Genome Sequencer 後,市面上的次世代定序儀呈百家爭鳴的現況,而無論哪種定序平台,上機前的建庫 (Library preparation) 是定序成功與否最關鍵之步驟。因此,如何進行建庫過程中與建庫完成後的質量控制相當重要。

NGS 建庫步驟繁多,主要有三個步驟: 1. 樣品片斷化 (Fragmentation) 2. 片斷化樣品與 adapter 接合 (Adaptor ligation) 3. 接合產物放大 (Library amplification)。而每個步驟透過質量的控制 (Quality control),可在定序分析前確定建庫品質以節省後續費用與確保定序後的資料量足夠進行生物資訊學 (Bioinformatics) 分析。

 

應用

Qsep 系列平台提供簡易、自動化的質量控制 (Quality Control)解決方案,只需幾個步驟,從樣品 (DNA/ RNA) 的純度到建庫每個步驟,產物片段大小 (size) 與品質驗證 (quality validation) 皆可透過 Qsep 系列平台得到詳細的品質控管資訊,而高靈敏度的 Qsep 平台,更可偵測 0.1 ng/ul 以下的樣品。