大片段DNA (High Molecular Weight DNA, HMW DNA)

大片段DNA (High Molecular Weight DNA, HMW DNA)

隨著生物技術的創新和進步,科學家能夠分離出的DNA片段長度增長,大片段 DNA (HMW DNA) 也隨之問世,成為基因體學研究的關鍵要角。現主要應用於第三代定序技術;然,在使用高成本的定序技術前,最重要的莫過於上機前的樣品品質控管。

Qsep 系列儀器搭配大片段專用卡匣 S3 (C105206) 或高靈敏度大片段專用卡匣 N3 (C105253),為使用者提供最新穎的生物分子分析平台,在 HMW DNA 的品質控管方面提供了快速、便利且可靠的解決方案。

 

          

高靈敏度特性

將 10kb library 樣品進行連續稀釋後,使用 N3 高靈敏度大片段卡匣 (C105153) 搭配 Qsep100 進行分析。偵測極限 (LOD) 可達 32.75pg /μL。

 

高度再現性

使用 S3 大片段卡匣於 Qsep100 測試 size marker (C109700) (片段範圍為 500bp - 23kb)。上圖可見高度再現性,每個訊號的變異係數 (CV%) 皆小於 2.0%。

上圖顯示了 4 種不同的高分子量 DNA ladder。

紅色訊號源為 size marker (C109700) (片段範圍為 500bp - 23kb)。

藍色訊號源為 Lambda DNA 被 Hind III 剪切後的產物。

綠色訊號源為 60K 的 DNA 被 Nco I 剪切後的產物。

黃色訊號源為 NipponGene 之 GT7 (10kb-165kb)。

以上結果為 Qsep100 搭配 S3 (C105206) 卡匣檢測之結果。